ANÁLISE COMPARATIVA DE ELEMENTOS REPETITIVOS NOS GENOMAS DE ESPÉCIES DA SUBTRIBO CASSIINAE
Cassiinae, DNA Repetitivo; Evolução genômica; Filogenia
Fabaceae (Leguminosae) é considerada uma das três maiores famílias de Angiospermae, contendo 765 gêneros e 19.500 espécies de distribuição cosmopolita. No Brasil são encontradas cerca de 2.756 espécies, sendo 1507 endêmicas. Diversos grupos de leguminosas têm tido sua classificação alterada ao longo do tempo, como é o caso da subtribo Cassiinae, que apresenta três gêneros resultantes da divisão de Cassia lato sensu: Cassia stricto sensu, Chamaecrista e Senna. Com base em análises filogenéticas, a tribo Cassiinae tem sido considerada complexa devido a hipóteses conflitantes em relação aos três gêneros que a constituem. Análises filogenéticas moleculares foram importantes para a contribuição da sistemática de Cassinae, mas não suficientes para elucidar as controvérsias que envolvem a relação entre esses gêneros. A inclusão de outras informações genômicas pode aumentar a resolução da análise e permitir a melhor definição das relações dentro do grupo. Assim, o objetivo do trabalho é verificar a similiaridade entre espécies representantes dos três gêneros de Cassiinae com relação à fração repetitiva do genoma. Será feito o sequenciamento de baixa cobertura de uma espécie de cada gênero (Senna Occidentalis, Cassia fistula e Chamaecrista ensiformes) na plataforma Illumina e as sequências serão avaliadas na plataforma RepeatExplorer, para avaliação da fração repetitiva de cada genoma, bom como para análise comparativa entre as três. Para as sequências satélite serão desenhados primers para construção de sondas para localização dessas sequências repetitivas nos cromossomos, via hibridização in situ fluorescente (FISH) para comparação dos cariótipos.