Fenotipagem de Alto Rendimento Para Avaliação de Hemileia vastatrix em Coffea arabica
Coffea arabica; Hemileia vastatrix; Fenotipagem; Melhoramento Genético
A principal doença que ataca o cafeeiro é a ferrugem alaranjada, causada pelo fungo Hemileia vastatrix.
Com isso, o foco dos programas de melhoramento genético do cafeeiro na obtenção de cultivares resistentes ao patógeno se torna cada vez mais essencial, a fim de minimizar os prejuízos por ele ocasionados à cafeicultura. A principal estratégia adotada para a avaliação dos genótipos resistentes à Hemileia vastatrix é a escala diagramática. A partir dela são dadas notas referentes ao comportamento do genótipo em relação à severidade ocasionada pelo fungo. Contudo, tais avaliações são feitas visualmente e dependem da experiência e treinamento do avaliador, além de apresentar problemas quando são comparadas avaliações entre avaliadores, uma vez que estas podem ser diferentes e chegar a resultados divergentes. Uma alternativa para a avaliação da severidade da doença é a utilização de imagens fotográficas e processamento em softwares para obtenção de resultados mais assertivos e conclusivos. Tal procedimento teria como vantagens: aumentar o tamanho amostral sem a demanda de mais mão-de-obra, o material analisado não é perdido com o tempo, as avaliações seguem um padrão determinado e todas as amostras são analisadas por igual, não há dependência do julgamento do avaliador e assim os resultados poderão ter maior confiabilidade. Diante disso, o objetivo deste trabalho é propor uma metodologia computacional para intensificar a velocidade e assertividade das avaliações da ferrugem do cafeeiro, baseada na captura e processamento de imagens obtidas por folhas afetadas pelo patógeno, e, a partir das análises obtidas, desenvolver e validar uma nova escala diagramática de avaliação da ferrugem do cafeeiro. Serão implantados dois experimentos, o primeiro será conduzido em mudas de cafeeiro no interior de casa de vegetação, enquanto o segundo experimento será conduzido em folhas destacadas alocadas em placas de Petri, em ambiente controlado. Ambos os experimentos serão inoculados com o fungo Hemileia vastatrix. Após o desenvolvimento da doença, serão realizadas as capturas de imagens de todas as folhas de ambos os experimentos para manipulação e quantificação da área foliar afetada pela doença. O processamento e análise de imagens serão realizados em ambiente Python, utilizando os pacotes OpenCV e Scikit-Image. Para a elaboração da escala diagramática, serão utilizadas as imagens e quantificações obtidas pela análisede imagem. A escala diagramática desenvolvida deverá ser validada por avaliadores sem experiência emavaliação visual, de modo que estes avaliadores farão uma avaliação sem o auxílio da escala e,posteriormente, outra avaliação utilizando-se da mesma. As severidades e notas de todos os avaliadoresserão analisadas pelo coeficiente de correlação de concordância proposto por Lin (1989). Espera-se comeste trabalho, tornar mais precisa e menos intuitiva a avaliação da severidade da ferrugem alaranjada docafeeiro presente nas lavouras de produção e de pesquisa. A adoção de ferramentas de fenotipagem de altorendimento pode possibilitar a obtenção de um grande número de dados de forma rápida, com maiorprecisão e eficiência. Desta forma o presente trabalho apresenta uma importante contribuição nodesenvolvimento tecnológico de ferramentas de análise de imagens para auxiliar os programas demelhoramento do cafeeiro.