ANÁLISE DA FRAÇÃO REPETITIVA DO DNA DE Cynodon Spp.
cynodon, DNA repetitivo, bioinformática
O gênero Cynodon engloba espécies que estão presentes por todo o mundo. Dentre elas, algumas se destacam pelo seu uso em gramados e alimentação animal, trazendo grande importância econômica. Para que se obtenha melhores resultados em seus diferentes usos e um melhor entendimento do gênero, é necessário aliar o estudo de diferentes áreas do conhecimento. No melhoramento genético, há poucos estudos sobre o DNA repetitivo em forrageiras e seus impactos no potencial genético da planta. Sendo assim, este trabalho objetiva realizar inferências acerca do DNA repetitivo em três espécies de cynodon, bem como estudar a relação evolutiva entre as espécies. Para isto, as espécies selecionadas terão o DNA extraído por kit de extração, e uma vez atendidos os parâmetros de qualidade analisados por meio de gel de agarose, as amostras serão enviadas para sequenciamento de baixa cobertura (0,5x) na plataforma de sequenciamento Illumina. As sequências obtidas serão tratadas no RepeatExplorer visando a maior qualidade e padronização das sequências. Após o tratamento, as sequências serão analisadas quanto aos elementos repetitivos. Após a anotação do resultado dos elementos repetitivos, primers serão desenhados para que por meio da técnica de hibridação in situ os elementos sejam localizados nos cromossomos das espécies.