POLIADENILAÇÃO ALTERNATIVA EM ESPÉCIES DA ALIANÇA TABEBUIA SOB ESTRESSE HÍDRICO
Poliadenilação alternativa; Regulação da expressão gênica; Controle pós-transcricional; Cauda poli-A.
A regulação da expressão gênica em resposta ao ambiente é um mecanismo indispensável em todo organismo vivo. Como indivíduos sésseis, em plantas este mecanismo é ainda mais importante, pois precisam adaptar rapidamente sua fisiologia/metabolismo a condições de estresses bióticos e abióticos. Um método de regulação pós-transcricional, que vem sendo estudado recentemente, é a poliadenilação alternativa (APA). Porém, os estudos existentes com este tema são, em sua maioria, na área de genética clínica. Pesquisas envolvendo APA em espécies vegetais são, portanto, de grande importância para uma melhor compreensão deste mecanismo como regulador da expressão gênica em plantas. Para isso, é importante que se conheça o transcritoma da espécie alvo de estudo. Nesse sentido, a RNA-seq apresenta-se como uma poderosa técnica de sequenciamento e quantificação de transcritomas completos. Com isso, o objetivo deste estudo é identificar eventos de poliadenilação alternativa em espécies da Aliança Tabebuia em condição de déficit hídrico. Para isso, dados RNA-seq de quatro espécies deste grupo (Tabebuia aurea, Handroanthus ochraceus, Handroanthus impetiginosus e Handroanthus serratifolius) submetidos a dois tratamentos (seca e úmida), serão utilizados. Para a identificação de eventos APA, será utilizado o programa APAtrap. Após identificados, os eventos APA serão classificados em CR-APA e UTR-APA, de acordo com o local de ocorrência, em íntrons/éxons ou em regiões 3’ não-traduzidas, respectivamente. Além disso, serão feitas análises funcionais para identificar se há categorias GO e KEGG enriquecidas. As ferramentas agriGO e KOBAS serão empregadas nesta etapa. Espera-se que haja variação dos eventos APA entre as espécies estudadas e que os genes apresentando estes eventos, estejam associados a vias metabólicas e categorias funcionais específicas de resposta à seca. Dessa forma, este estudo deve contribuir para uma melhor compreensão dos efeitos da poliadenilação alternativa na regulação da expressão gênica em plantas.