Banca de DEFESA: DANIELA OLIVEIRA ORNELAS

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: DANIELA OLIVEIRA ORNELAS
DATA: 29/01/2021
HORA: 14:00
LOCAL: Departamento de Biologia - Remoto
TÍTULO:

Análise da fração repetitiva do DNA de espécies do gênero Cynodon L. C. Rich

PALAVRAS-CHAVES:

cynodon, DNA repetitivo, bioinformática

PÁGINAS: 20
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
RESUMO:

O gênero Cynodon pertence à família das gramíneas (Poaceae) e engloba espécies presentes por todo o mundo. Dentre elas, algumas se destacam economicamente pelo seu uso em gramados e alimentação animal. A variabilidade de Cynodon implica em dificuldade de classificação das espécies e das variedades, sendo necessárias ferramentas moleculares para auxiliar nesta tarefa. A fração repetitiva do DNA pode ser muito informativa, apresentando custo inferior de sequenciamento comparado ao genoma completo. Sabendo que poucos são os estudos desta porção do genoma em Cynodon, este trabalho objetiva realizar inferências acerca do DNA repetitivo em três espécies do gênero, e também estudar a relação evolutiva entre elas. Para isso, o DNA genômico das espécies foi extraído e sequenciado com baixa cobertura (0,5x) na plataforma de sequenciamento Illumina. As sequências obtidas foram tratadas no RepeatExplorer visando a maior qualidade e padronização das sequências e analisadas para caracterização quantitativa e qualitativa da fração repetitiva em análises individuais e comparativas na mesma plataforma. As três espécies apresentaram proporção similar de DNA repetitivo e acima de 80%: 88,27% (Cynodon nlemfuensis), 85,59% (Cynodon dactylon) e 86,93% (Cynodon incompletus). As duas primeiras foram mais similares com 56% e 51%, respectivamente, de elementos transponíveis e 32% e 35% de satélites. Por outro lado, C. incompletus diferenciou com 39% da fração composta por elementos transponíveis e 48% de satélites, ou seja uma proporção maior de DNA satélite. Para as três espécies a Ordem LTR (Long Tandem Repeat) foi a mais abundante. Foram identificados um total de 28 satélites, dos quais apenas cinco não foram compartilhados entre todas as espécies. Para as sequências satélite C. incompletus foi também o que mais se diferenciou.

 

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - GIOVANA AUGUSTA TORRES (Membro)
Interno - VANIA HELENA TECHIO (Membro)
Interno - EVANDRO NOVAES (Suplente)
Externo à Instituição - MARIANA BAEZ - UFPE (Membro)
Externo à Instituição - CRISTINA MARIA PINTO DE PAULA - UFMG (Suplente)