Banca de DEFESA: BETTY ALESSANDRA DEL MILAGRO RIVERA AYASTA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: BETTY ALESSANDRA DEL MILAGRO RIVERA AYASTA
DATA: 25/03/2022
HORA: 13:00
LOCAL: remoto
TÍTULO:

CARACTERIZAÇÃO DOS MICROSSATÉLITES NO GENOME DE Handroanthus impetiginosus (Mart. ex DC.) Mattos E DESENVOLVIMENTO DE MARCADORES SSR

PALAVRAS-CHAVES:

Ipê-roxo. Microssatélites. Eletroforese capilar. Floresta

PÁGINAS: 45
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Recursos Florestais e Engenharia Florestal
SUBÁREA: Silvicultura
ESPECIALIDADE: Genética e Melhoramento Florestal
RESUMO:

O ipê-roxo (Handroanthus impetiginosus) é uma espécie florestal muito conhecida da flora brasileira. Esta espécie se encontra distribuída desde América do Norte até América do Sul e apresenta importância econômico devido ao valor da sua madeira, além de fornecer paisagens admiráveis devido a suas inflorescências volumosas. O ipê-roxo (Handroanthus impetiginosus) ainda não possui marcadores microssatélites desenvolvidos. Essa falta de marcadores moleculares, limita as possibilidades de estudos de genética seja em populações naturais ou em eventuais populações para melhoramento da espécie. Desta forma, este trabalho tem o objetivo de identificar e caracterizar os locos microssatélites no genoma de H. impetiginosus, bem como desenvolver marcadores SSR para a espécie. Para identificar as regiões microssatélites de H. impetiginosus foram utilizadas as sequências do genoma da espécie, disponível no Banco do NCBI. As sequências foram submetidas ao programa MISA, que localiza e classifica os microssatélites quanto ao tipo e número de repetições. No genoma do ipê-roxo, foram detectadas 85.473 regiões microssatélites, sendo 53% mononucleotídeos, 36% dinucleotídeos, 5% trinucleotídeos, 1% tetranucleotídeos e 5% compostos. O tipo de motivo dinucleotídeos mais frequente foi AT/AT com 45% e de trinucleotídeos foi o AAT/ATT com 21%. A maioria dos microssatélites foi localizada em regiões intergênicas (86%) e íntrons (12%). Para desenvolvimento de marcadores, os 50 maiores locos microssatélites intergênicos do tipo di- e tri-nucleotídeos foram selecionados para desenho de primers e posterior amplificação via reação em cadeia da polimerase (PCR). A qualidade das amplificações foi verificada em gel de agarose, e os 20 locos com melhores resultados tiveram um de seus primers marcados com fluoróforos (6-FAM, NED ou JOE) para genotipagem de alta resolução via eletroforese capilar. Esses 20 locos foram avaliados em uma triagem com cinco amostras de H. impetiginosus. Os nove melhores locos polimórficos foram selecionados para a genotipagem final em uma amostra de 20 indivíduos de H. impetiginosus. Nessa genotipagem obteve-se uma média de 7.89 alelos por loco, heterozigosidade observada de 0.72 e esperada de 0.78. A transferabilidade desses nove locos também foi testada em nove amostras de Handroanthus serratifolius e oito amostras de Handroanthus ochraceus. Desses nove locos, sete amplificaram em H. serratifolius e quatro em H. ochraceus. A transferabilidade dos locos também foi avaliada em Tabebuia roseoalba e Tabebuia aurea mas nenhum deles amplificou. Entre as espécies genotipadas com sucesso foram identificados 54, 41 e 17 alelos privados em H. impetiginosus, H. serratifolius e H. ochraceus, respectivamente. De forma geral, os marcadores microssatélites desenvolvidos nesse trabalho em H. impetiginosus permitem a análise da diversidade genética não somente nessa espécie como também em H. serratifolius e H. ochraceus.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - VANIA HELENA TECHIO (Suplente)
Externo à Instituição - ROSANE GARCIA COLLEVATTI - UnB (Membro)
Externo à Instituição - MARCELA PEDROSO MENDES - UFG (Suplente)
Presidente - EVANDRO NOVAES (Membro)
Externo ao Programa - DULCINEIA DE CARVALHO - DCF/ESAL (Membro)