Banca de DEFESA: ALEX JUNIOR APARECIDO SILVESTRINI

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ALEX JUNIOR APARECIDO SILVESTRINI
DATA: 14/10/2020
HORA: 08:00
LOCAL: Departamento de Biologia - Remoto
TÍTULO:

Análise genômica comparativa da fração repetitiva e do genoma cloroplastidial de espécies de Cenchrus L.

PALAVRAS-CHAVES:

Cenchrus; DNA Repetitivo; Evolução genômica; Genoma Cloroplastidial.

PÁGINAS: 93
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
RESUMO:

Cenchrus L. é um importante gênero da família Poaceae que abriga diversas espécies de elevada importância agronômica, principalmente forrageiras de destaque na pecuária nacional, como Cenchrus purpureus, Cenchrus americanus e Cenchrus ciliaris. Diversos programas de melhoramento genético exploram a capacidade de produção e qualidade dessas forrageiras. Além disso, são interessantes para estudos genômico-evolutivos, uma vez que possuem genomas relativamente grandes e combinações poliploides complexas. Estudos genômicos utilizando sequenciamento de próxima geração (NGS) com baixa cobertura vem se mostrando uma interessante ferramenta para caracterização do germoplasma e estudos de evolução genômica. Esses estudos permitem desde a caracterização da fração repetitiva do genoma de uma espécie, até a montagem de seu genoma cloroplastidial. Sendo assim, o objetivo do presente trabalho é a análise genômica comparativa da fração repetitiva do genoma de Cenchrus purpureus e Cenchrus americanus, assim como do genoma cloroplastidial de Cenchrus purpureus, Cenchrus americanus e Cenchrus ciliaris. Para tanto, o genoma de C. purpureus e C. americanus foi sequenciado em palataforma Illumina HiSeq™ 4000 e analisado através do pipeline implementado na plataforma RepeatExplorer. Para a análise e montagem do genoma cloroplastidial, além dos genomas sequenciados, foi obtido o genoma cloroplastidial de C. ciliaris depositado sob o acesso MH286942 no banco de dados NCBI. A montagem e análise comparativa do cpDNA foi realizada através de ferramentas implementadas no software Geneious Prime 2020.1.1 e através de pipelines presentes em plataformas específicas como a CHLOROBOX – GeSeq. A fração repetitiva do genoma de C. purpureus e C. americanus corresponde a 52,23 e 76,82%, respectivamente e os elementos repetitivos mais abundantes em ambas são os LTRs. Foram ainda identificadas sequências de DNA satélite em ambos os genomas que correspondem a 2,55 e 4.17% do genoma de cada espécie, respectivamente. A relação ancestral, assim como os ciclos de poliploidização-diploidização que envolvem ambas as espécies, tiveram um papel fundamental na composição da fração repetitiva das mesmas. Os processos evolutivos inerentes às sequências de DNA satélite são a base da diferenciação e amplificação dessa região genômica de Cenchrus purpureus e Cenchrus americanus. O genoma cloroplastidial de Cenchrus purpureus, Cenchrus americanus e Cenchrus cilairis possui comprimento e composição extremamente similares, corroborando com a estreita relação filogenética entre essas espécies, assim como com a já conhecida conservabilidade desse genoma entre espécies de gramíneas, principalmente espécies de Cenchrus.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - GIOVANA AUGUSTA TORRES (Membro)
Interno - VANIA HELENA TECHIO (Suplente)
Externo à Instituição - MAGDALENA VAIO SCVORTZOFF - URep (Membro)
Externo à Instituição - LUIZ GUSTAVO RODRIGUES SOUZA - UFPE (Membro)
Externo à Instituição - LUDMILA CRISTINA OLIVEIRA - UFLA (Suplente)