Banca de DEFESA: CLARA MITRE DO PRADO

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: CLARA MITRE DO PRADO
DATA: 29/04/2021
HORA: 13:30
LOCAL: Departamento de Biologia - Remoto
TÍTULO:

FRAÇÃO DO DNA REPETITIVO NA ESPÉCIE DE BATATA SILVESTRE Solanum calvescens Bitter E ESPÉCIES RELACIONADAS

PALAVRAS-CHAVES:

DNA, fração repetitiva, batata, Solanum, genômica, Repeat Explorer

PÁGINAS: 60
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
RESUMO:

O gênero Solanum, Família Solanaceae, contém mais de 1500 espécies catalogadas, das
quais 160, todas da Seção Petota, produzem tubérculos. As espécies de batata silvestres se
encontram organizadas na seção Petota, que contém certa de 100 espécies nativas e
cultivadas da América do Sul, e série Commersoniana, que representa as espécies silvestres
aqui estudadas. Os programas de melhoramento genético têm desenvolvido cultivares
visando aumento de produtividade, qualidade do tubérculo e resistência ou tolerância a
estresses bióticos e abióticos. Nesse sentido, a busca de alelos de interesse em espécies
nativas constitui uma estratégia promissora. A espécie triploide nativa S. calvescens é uma
das espécies potenciais para uso no melhoramento da batata, porém carrega uma história
genética e evolutiva inconclusiva. Ela não é considerada como espécie por alguns autores,
sendo definida como espécie sinônima a S. chacoense, por aspectos morfológicos, enquanto
outros autores a consideram próxima de S. commersonii subsp. malmeamum. Há ainda a
possibilidade que a mesma seja um híbrido entre os dois taxas, evento já identificado
anteriormente no gênero. Como a espécie é descrita como triploide (2n=3x=36), a barreira
da ploidia pode ser um empecilho na introdução de alelos, uma vez que a batata cultivada (S.
tuberosum) é tetraploide (2n=4x=48). As circunstâncias que rodeiam a origem filogenética
de S. calvescens nos convidam a investigar seu genoma através das técnicas científicas,
citogenéticas e citogenômicas, disponíveis atualmente. Este presente estudo visou
decodificar a fração repetitiva do DNA desta espécie nativa, de forma comparativa com suas
espécies relacionadas, a fim de reunir novas informações genômicas sobre o taxa, que
possam trazer à luz elementos destas relações parentais, e prover alternativas no
melhoramento futuro da mesma. Para as análises, foi utilizado sequenciamento de baixa
cobertura da espécie Solanum calvescens, a qual também foi submetida à análise por

Citometria de Fluxo, a fim de determinar o tamanho do genoma. Para as espécies Solanum
chacoense, Solanum commersonii e Solanum malmeamum, Solanum etuberosum, foram
utilizados dados sequenciados e compartilhados em parceria com o Laboratorio de
Evolución y Domesticación de las Plantas do Departamento de Biología Vegetal da
Facultad de Agronomía.de Montevideo, no Uruguai. Os arquivos de sequenciamento
digitais das espécies foram inseridos na plataforma online do Repeat Explorer, Galaxy
RepeatExplorer portal, onde se deram todas as etapas de pré-processamento, análises das
sequências em tandem e análise comparativa dos elementos transponíveis. O software
Geneious foi utilizado para o alinhamento, identificação e quantificação dos satélites. O
tamanho do genoma de S. calvescens se revelou maior em comparação às espécies
relacionadas, o que pode ser explicado pela triploidia e local de origem distinto. A
quantidade de DNA repetitivo presente nas espécies variou entre 38,37% do genoma em S.
calvescens, até 45,37% em S. chacoense, com predominância do grupo LTR e superfamília
Ty3/gypsy em todas as espécies. Todos os satélites mapeados obtiveram identidade inferior a
50%, agrupando-os somente em nível de superfamília.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - VANIA HELENA TECHIO (Suplente)
Externo à Instituição - PAOLA GALERO - WAGENINGEN (Membro)
Externo à Instituição - MAGDALENA VAIO - UNTRM (Suplente)
Externo à Instituição - LUDMILA CRISTINA OLIVEIRA - UFLA (Membro)
Presidente - GIOVANA AUGUSTA TORRES (Membro)