Banca de QUALIFICAÇÃO: GIOVANNA ANGELI BELO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: GIOVANNA ANGELI BELO
DATA: 24/07/2023
HORA: 08:00
LOCAL: Google Meet
TÍTULO:

Caracterização de sequências repetitivas em tandem em espécies de Cynodon Rich. (Poaceae)

PALAVRAS-CHAVES:

DNA satélite; repeatome; grama bermuda; análise bioinformática gramíneas forrageiras

PÁGINAS: 37
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Agronomia
RESUMO:

A fração repetitiva do DNA que compõe a maior parte do genoma dos eucariotos, é constituída por sequências dispersas (elementos transponíveis) e em tandem (satDNA ou DNA satélite). O DNA satélite está localizado principalmente em regiões heretocromáticas e apresentam um alto grau de polimorfismo. A inclusão de sondas específicas satDNA aumenta a resolução dos cariótipos especialmente em estudos de espécies que apresentam poliploidia e cromossomos pequenos, como as do gênero Cynodon. Os cariótipos descritos de algumas espécies do gênero mostram polimorfismos cromossômicos intra e interespecíficos, com base na observação de blocos de heterocromatina evidenciados por CMA e DAPI e mapeamento dos sítios ribossomais, mas ainda são insuficientes para diferenciar os cromossomos das espécies e citótipos. Sendo assim, levando em consideração os recursos da bioinformática disponíveis, o objetivo deste estudo foi identificar, caracterizar e comparar as sequências repetitivas em tandem nas espécies diploides Cynodon dactylon, C. incompletus e C. nlemfuensis. Após o sequenciamento NGS de baixa cobertura, os dados tratados demonstraram que o genoma das três espécies estudadas é composto por pouco mais de 60%, com a porcentagem de DNA satélite variando entre 11% e 17%. Dentre os 19 satélites identificados, destacam-se satélites compartilhados entre as três espécies, ou pelo menos entre duas espécies e satélites espécie-específicos. Os resultados obtidos in sílico foram confirmados através da amplificação das sequências e mostram-se promissores para aplicação na FISH visando a construção de cariótipos com maior resolução para C. dactylon, C. incompletus e C. nlemfuensis e conferir mais informações sobre o processo evolutivo do gênero.

 

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - VANIA HELENA TECHIO (Membro)
Externo à Instituição - MAGDALENA VAIO SCVORTZOFF - URep (Membro)
Interno - GIOVANA AUGUSTA TORRES (Membro)
Interno - EVANDRO NOVAES (Suplente)