Análise de rede de interação proteína-proteína do ‘factorome’ de Phaseolus vulgaris indica AP2/ERF, WRKYs e NAC como reguladores-chave na defesa contra Colletotrichum lindemuthianum raça 65
Phaseolus vulgaris, Colletotrichum lindemuthianum raça 65, fatores de transcrição (TFs), redes de interação proteína–proteína (PPI), imunidade desencadeada por PAMPs (PTI), imunidade desencadeada por efetores (ETI)
Fatores de transcrição (TFs) são “interruptores” moleculares que regulam a expressão gênica para orquestrar as respostas das plantas a diversos estímulos. Apesar de estudos extensivos em espécies-modelo, a regulação transcricional das respostas imunes em plantas cultivadas, como o feijão-comum (Phaseolus vulgaris), ainda é pouco compreendida. O fungo hemibiotrófico Colletotrichum lindemuthianum raça 65 afeta severamente a produtividade do feijão, porém os circuitos regulatórios que mediam interações incompatíveis são amplamente desconhecidos. Aqui, apresentamos uma análise integrada do “fatoroma” do feijão-comum, combinando fatores de transcrição diferencialmente expressos (TFDex) e fatores de transcrição coexpressos (TFCoDex) em redes de interação proteína–proteína (PPI) preditas pelo STRING DB. Nosso estudo identificou famílias-chave de TFs, incluindo WRKY, NAC, AP2/ERF e bZIP, como nós centrais que orquestram respostas imunes. A análise temporal revelou uma reprogramação dinâmica da atividade de TFs entre os estágios iniciais (48 h.p.i.) e tardios (96 h.p.i.) da infecção, refletindo uma transição de sinalização mediada por ácido salicílico (SA) para sinalização mediada por jasmonato/etileno (JA/etileno). Motivos de rede, como loops feed-forward e circuitos autorregulatórios, destacam mecanismos que garantem robustez e ajuste fino das vias de defesa. A integração de componentes da imunidade desencadeada por PAMPs (PTI) e da imunidade desencadeada por efetores (ETI), incluindo NB-LRRs e receptor semelhantes a quinases, ressalta uma rede de sinalização cooperativa que converge na regulação transcricional, na sinergia hormonal e na modulação de espécies reativas de oxigênio. Módulos enriquecidos para ritmo circadiano, metabolismo secundário e reforço da parede celular revelam estratégias de defesa em múltiplas camadas. De maneira geral, nossos achados fornecem a primeira caracterização abrangente do panorama regulatório centrado em TFs em P. vulgaris durante a infecção por C. lindemuthianum raça 65, oferecendo pistas sobre TF hubs, integração de sinalização e potenciais alvos moleculares para programas de melhoramento voltados à resistência a doenças.