Banca de QUALIFICAÇÃO: DENISE DE ASSIS PAIVA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: DENISE DE ASSIS PAIVA
DATA: 14/06/2022
HORA: 14:00
LOCAL: Video Conferência
TÍTULO:

Uso dos métodos natural vector e k-mer na análise de similaridade entre genomas de coronavírus

PALAVRAS-CHAVES:

Dados de covid. Métodos livres de alinhamento. Árvores de classificação.

PÁGINAS: 40
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Probabilidade e Estatística
SUBÁREA: Probabilidade e Estatística Aplicadas
RESUMO:

O mundo enfrentou e ainda enfrenta uma pandemia sem data para finalizar. O Brasil é um dos países com maior número de mortos e infectados por meio da covid-19, até o momento apresenta índice de infectados e mortes diárias, mesmo com a maior parte da população totalmente vacinada. Dessa forma, tendo em vista todos os dados disponíveis com relação a síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-cov-2), o objetivo deste trabalho, é estudar dois métodos livres de alinhamento, k-mer e o natural vector, analisando 10 sequências genômicas de covid, com o intuito de classificá-las através de árvores filogenéticas e verificar similaridades entre elas. As sequências utilizadas na pesquisa foram obtidas a partir dos registros junto ao Centro Nacional de Informação em Biotecnologia (NCBI) e correspondem ao período de 2020 e 2021. Com isso, para o método k-mer observou-se que as sequências que possuíam as mesmas variantes ficaram agrupadas, enquanto que para o método natural vector, tanto com 12 componentes quanto 16, as variantes se misturaram dentro dos grupos, sendo que as sequências relacionadas às mesmas cidades ficaram em grupos análogos.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - THELMA SAFADI (Membro)
Interno - TALES JESUS FERNANDES (Membro)
Interno - PAULO HENRIQUE SALES GUIMARAES (Suplente)
Externo à Instituição - KARLA SUEMY CLEMENTE YOTOKO - UFV (Membro)
Externo ao Programa - CAMILLA MARQUES BARROSO - DES/ICET (Membro)