ENDOPHYTIC MICROORGANISMS: IDENTIFICATION, PROSPECTION OF FUNCTIONAL GENES, PLANT GROWTH PROMOTION AND BIOLOGICAL CONTROL OF DISEASES IN COMMON BEANS
coinoculação, inoculação, genoma, doenças fungicas de feijão, Paenibacullus, Pseudomonas
O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma cultura de importância primordial no Brasil, por isso deve apresentar qualidade e alta produtividade. Um dos problemas encontrados em áreas de cultivo de feijão é a
presença de fungos fitopatogênicos. Entre esses fungos temos o Colletotrichum lindemuthianum, causador da antracnose, Sclerotinia sclerotiorum que causa o mofo branco, Pseudocercospora griseola que causa a mancha angular e Rhizoctonia solani que pode causar no feijão a podridão-radicular e em casos extremos o tombamento das plantas. O controle biológico é uma estratégia cada vez mais bem-sucedida para diminuir os patógenos de plantas e os efeitos negativos de defensivos químicos no ambiente ao longo do tempo. A utilização de microrganismo benéficos, sendo eles fungos ou bactérias pode auxiliar na neutralização de patógenos, promover o crescimento de plantas, e reduzir a utilização de produtos químicos na agricultura. O genoma consiste em todo material genético retido nos organismos, o qual inclui toda a informação necessária para o ciclo e manutenção de vida do indivíduo avaliado. O estudo de genomas de bactérias endofíticas responsáveis pelo controle de doenças é relativamente novo e pode ser uma importante ferramenta para a descoberta de possíveis novas moléculas com potencial biotecnológico, e um aprofundamento sobre suas propriedades, contribuindo para o desenvolvimento de produtos aplicáveis na agricultura e em áreas afins. O objetivo deste trabalho foi realizar ensaios in vitro e in vivo com o fungo endofitico CML 4019 (Induratia coffeana) e as bactérias endofiticas, UFLA 02-281, UFLA 02-293, UFLA 03-18 e UFLA 03-10, inoculados sozinhos e em coinoculação para avaliar o potencial de controle dos fungos fitopatogênicos Colletotrichum lindemuthianum, Sclerotinia sclerotiorum, Pseudocercospora griseola e Rhizoctonia solani, causadores de doenças do feijoeiro. Nos ensaios in vivo foram utilizadas duas cultivares de feijão comum, BRS Notável e Perola. Entre as estirpes bacterianas estudas a estirpe UFLA 03-10 apresentou o melhor resultado nos ensaios in vitro e nos ensaios in vivo quando inoculada de forma isolada. O fungo endofítico inoculado sozinho CML 4019 apresentou controle sobre as doenças, principalmente nos ensaios de Rhizoctonia solani e Colletotrichum lindemuthianum. O DNA das estirpes UFLA 02-281, UFLA 02-293, UFLA 03-18, e UFLA03-10 foi extraído para a realização do sequenciamento do genoma. A classificação a nível de espécie foi realizada com o cálculo de ANI (Average Nucleotide Identity) considerando que os valores de ANI dos genomas das estirpes abaixo de 96% como novas espécies. A estirpe UFLA 03-10 classificada como Paenibacillus peoriae, UFLA 02-281 classificada como Pseudomonas xanthosomatis, UFLA 02-293 classificada como Pseudomonas cremoris e UFLA 03-18 classificada como Pseudomonas bananamidigenes. Genes relacionados a promoção de crescimento de plantas e controle biológico de doenças foram detectados em todas as 4 estirpes bacterianas.