Banca de DEFESA: LORENA GRACIELLY DE ALMEIDA SOUZA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: LORENA GRACIELLY DE ALMEIDA SOUZA
DATA: 09/07/2024
HORA: 15:00
LOCAL: Sala de reunião Google Meet
TÍTULO:

ANÁLISE in silico DE COMPONENTES DA SINALIZAÇÃO PTI (PAMP-triggered immunity) NO GENOMA DE Coffea arabica, Coffea canephora e Coffea eugenioides EM RESPOSTA A FITONEMATÓIDES

 

 

PALAVRAS-CHAVES:

Café. Nematologia. PTI. Planta-Patógeno

PÁGINAS: 76
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Agronomia
SUBÁREA: Fitossanidade
ESPECIALIDADE: Fitopatologia
RESUMO:

O Brasil é o maior produtor e exportador mundial de café, com destaque
para o estado de Minas Gerais. A espécie mais cultivada é a Coffea arabica
(alotetraploide), oriunda do cruzamento natural entre duas espécies diploides, Coffea
canephora e Coffea eugenioides. A produção de café movimenta a economia brasileira,
entretanto, além de outros patógenos, os fitonematoides geram perdas significativas e
uma vez presentes no solo sua erradicação é praticamente impossível. Uma maneira de
encontrar alternativas para o controle de doenças é a compreensão dos mecanismos
vegetais para ativação da defesa. Sabe-se as plantas reconhecem padrões moleculares
associados a patógenos (PAMPs- Pathogen-associated molecular pattern). Esses
PAMPs são reconhecidos por receptores de reconhecimento de padrões (PRRs- pattern-
recognition receptors), gerando uma cascata de sinalizações até a ativação da imunidade
desencadeada por PAMP (PTI – PAMP Triggered immunity). Dessa forma, a
identificação de PRRs para NAMPs (nematode-associated molecular patterns) seus
correceptores, além de proteínas chaves para a resposta do tipo PTI, são importantes
para buscar estratégias de controle contra nematoides. Diante disso, objetivou-se
identificar e caracterizar o PRR NILR1, específico para nematoide, seu correceptor
BAK1 e os genes/proteínas chaves da explosão oxidativa, as RBOHs, nos genomas de
C. arabica, C. canephora e C. eugenioides. Além disso, desenhar primers específicos
para esses genes em C. arabica. Para isso, foram realizadas análises de comparação de
sequências (BLASTp) utilizando como base proteínas de referência descritas em
Arabidopsis thaliana, análises filogenéticas, incluindo proteínas ortólogas descritas em
outras espécies de plantas, caracterização de domínios proteicos, localização subcelular,
distribuição cromossômica e caracterização dos genes, além do desenho de primers.
Após as análises BLASTp e filogenética, foram identificadas duas sequências
candidatas a NILR1 em C. arabica, cada uma delas oriunda de um subgenoma. Já para
as espécies diploides apenas um NILR1 foi selecionado. Para BAK1, três sequências
foram selecionadas em C. arabica, sendo uma delas isoforma. Assim como para
NILR1, as proteínas BAK1 são codificadas por genes oriundos de cada um dos
subgenomas. Para as espécies diploides apenas uma sequência foi selecionada. Quando
se analisou as RBOHs, observou-se que C. arabica apresenta nove proteínas desta
família, sendo uma delas isoforma. Duas RBOHs não apresentaram correspondentes nos
dois subgenomas, indicando perca de dois membros desta família para esta espécie. Já
C. canephora e C. eugenioides apresentam cinco proteínas candidatas cada. Observou-
se que as sequências mais próximas de AtRBOHD e AtRBOHF, caracterizados como
mais atuantes na explosão oxidativa contra fitopatógenos, são anotadas como RBOHC e
RBOHA nos genomas de café, respectivamente. As sequências selecionadas como
candidatas a NILR1, BAK1 e RBOHs apresentam domínios característicos das
proteínas de referência, indicando que possivelmente exercem as mesmas funções.
Além disso, todas elas foram preditas por atuarem na membrana plasmáticas. Os
primers desenhados são específicos para as sequências alvos, o que dar suporte para
estudos moleculares, a exemplo da análise de expressão gênica, o que pode contribuir
substancialmente para compreender o papel destas proteínas chaves da PTI para

interação café-nematoide. Em suma, os resultados encontrados podem dar suporte a
estratégia biotecnológicas para o controle de fitonematoides no café.

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - ACLEIDE MARIA SANTOS CARDOSO - INCT CAFE (Suplente)
Externo à Instituição - LÍVIA PIMENTA TEIXEIRA - EPAMIG (Suplente)
Presidente - MARIO LUCIO VILELA DE RESENDE (Membro)
Externo à Instituição - SINARA OLIVEIRA DE AQUINO - IAC (Membro)
Externo à Instituição - VICTOR HUGO MOURA DE SOUZA - UC (Membro)