Banca de DEFESA: TAINÁH MARTINS RESENDE SANTOS

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: TAINÁH MARTINS RESENDE SANTOS
DATA: 16/02/2023
HORA: 08:00
LOCAL: remoto
TÍTULO:

EMPREGO DE COMPLEXOS DE VANÁDIO PARA MANIPULAR A AUTOFAGIA: CÁLCULOS QUÂNTICOS E DESENVOLVIMENTO DE PARÂMETROS DE CAMPO DE FORÇA

PALAVRAS-CHAVES:

Autofagia; modulação; complexo de vanádio; campo de força AMBER; dinâmica molecular.   

PÁGINAS: 165
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Agronomia
RESUMO:

A modulação da autofagia tem se apresentado como uma estratégia muito útil no combate ao câncer. Nesse sentido, sabe-se que complexos de vanádio (CV) são capazes tanto de inibir quanto de induzir a autofagia em células cancerosas. Neste trabalho, foram utilizados dois complexos de vanádio. O primeiro, [VO(oda)(phen)], possui comprovada eficiência em inibir a autofagia em células do câncer de pâncreas. Já o segundo, [VO(bpy)₂Cl], é conhecido por possuir a capacidade de induzir a autofagia em células do câncer de mama triplo-negativo. Neste contexto, simulações de Dinâmica Molecular (DM) são excelentes estratégias para investigar a interação de complexos metálicos e seus alvos biológicos. Entretanto, simulações desse tipo são fortemente dependentes da escolha adequada do campo de força (FF, do inglês Force Field). FFs gerais não são eficientes para descrever as propriedades de complexos metálicos. Além disso, ainda não foram relatados na literatura FFs específicos para os CVs, alvos deste estudo. Sendo assim, esta tese apresenta uma rica investigação dividida em três partes: desenvolvimento, validação e aplicação. Portanto, inicialmente é proposto o desenvolvimento de parâmetros de FF AMBER para os dois CVs, a partir de uma estrutura de mínima energia, obtida por cálculos de DFT com nível de teoria B3LYP/def2-TZVP mais ECP para o átomo de vanádio. A partir da geometria otimizada, os cálculos da matriz hessiana e das cargas RESP foram realizados para fornecer as cargas de cada átomo, as constantes de força e os valores de equilíbrio. Os parâmetros de Lennard-Jones para todos os átomos, exceto para o vanádio, foram atribuídos de acordo com o GAFF. Simulações de DM no vácuo foram realizadas para validar os FFs desenvolvidos. A partir de análises estruturais, foi possível encontrar valores com apreciáveis acordos entre os dados experimentais e a referência quântica. A partir dos FFs desenvolvidos e validados, foi possível investigar, através de docking e DM, as interações entre os CVs e as proteínas PI3K e ULK1, cruciais para o maquinário autofágico. Análises de RMSD, ligações de hidrogênio e RMSF foram realizadas. Além disso, apresentamos como os CVs agem para inibir/induzir a autofagia e sugerimos como seria possível modificar as atuações dos complexos para que a modulação da autofagia ocorra. Em linhas gerais, nossos achados encorajam novas parametrizações de complexos metálicos com significativas importâncias biológicas, bem como permitem contribuir para a elucidação do complexo processo de autofagia.

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - WILLIAN RICARDO ROCHA - UFMG (Membro)
Presidente - TEODORICO DE CASTRO RAMALHO (Membro)
Externo à Instituição - PAULA HOMEM DE MELLO - UFABC (Membro)
Externo à Instituição - NELSON HENRIQUE TEIXEIRA LEMES - UNIFAL (Suplente)
Interno - MATHEUS PUGGINA DE FREITAS (Suplente)
Externo à Instituição - Luciano Tavares da Costa - UFF (Membro)
Externo à Instituição - GERD BRUNO DA ROCHA - UFPB (Membro)