Vigilância genômica em patógenos de importância na saúde pública e animal: Escherichia coli e Staphylococcus aureus
Resistência; Zoonoses; Filogenômica; Epidemiologia
A vigilância genômica de patógenos bacterianos de relevância clínica e zoonótica é fundamental para esclarecer a dinâmica de disseminação da resistência antimicrobiana, a variabilidade de fatores de virulência e os padrões evolutivos que permeiam diferentes sistemas produtivos e populações hospedeiras. Escherichia coli e Staphylococcus aureus figuram entre os agentes de maior importância nesse contexto, tanto pelo impacto direto na saúde animal e nas perdas econômicas associadas, especialmente em enfermidades como a mastite bovina, quanto pelo potencial de transmissão para humanos, reforçando o enfoque One Health. Embora os métodos fenotípicos continuem essenciais na rotina diagnóstica, abordagens genômicas possibilitam uma caracterização mais precisa do repertório de genes de resistência, da estrutura clonal e das relações filogenéticas, ampliando a capacidade de monitoramento e resposta frente a ameaças emergentes. Este trabalho integra dados fenotípicos e genômicos de E. coli e S. aureus isolados de diferentes hospedeiros, com o objetivo de avaliar perfis de resistência antimicrobiana, diversidade de virulência e estrutura filogenética de populações bacterianas de relevância para a saúde pública e animal. Para isso, foram aplicadas metodologias padronizadas de determinação da suscetibilidade antimicrobiana, incluindo MIC e disco-difusão, associadas ao sequenciamento de nova geração para montagem e anotação genômica. As análises incluíram identificação de genes de resistência e virulência, detecção de elementos genéticos móveis, tipagem multilocus (MLST) e reconstruções filogenômicas baseadas em SNPs, permitindo uma avaliação integrada da diversidade clonal. Os resultados evidenciaram ampla heterogeneidade fenotípica e genotípica entre os isolados, com múltiplos padrões de resistência antimicrobiana e um extenso repertório de genes de resistência e virulência. Elementos móveis e complexos clonais distintos foram identificados, destacando a plasticidade genômica desses patógenos. A comparação entre hospedeiros demonstrou circulação de linhagens com potencial zoonótico e ampla diversidade estrutural nas populações bacterianas. Em conjunto, os achados reforçam a importância de estratégias contínuas e integradas de vigilância genômica para o monitoramento da emergência e disseminação de resistência e de variantes clonais em contextos críticos de saúde pública e animal.