ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA DIFERENCIAL ENTRE LARVAS E FORMIGAS FORRAGEADORAS DE Atta sexdens VIA RNA-Seq
Formigas cortadeiras. Transcriptoma. Expressão gênica diferencial
O sequenciamento de RNA (RNA-Seq) pode ser empregado visando elucidar as diferenças de expressão gênica existentes entre estádios de desenvolvimento, tecidos e diferentes condições fisiológicas dos organismos ao mapear e quantificar o conjunto completo dos transcritos, contribuindo para o entendimento da biologia de insetos e geração de novas tecnologias no controle de pragas. O objetivo deste trabalho consiste em manipular dados provenientes do sequenciamento de transcritos da formiga cortadeira Atta sexdens para se obter o perfil de genes diferencialmente expressos em diferentes amostras biológicas (larva inteira, intestino de larva, formiga forrageadora inteira, intestino de formiga forrageadora e cabeça de formiga forrageadora). Para isso serão empregados softwares especializados (CORNAS, GFold e NOISeq) na identificação de genes diferencialmente expressos, a partir de bibliotecas sem replicata biológica. As informações geradas serão integradas a um único banco de dados de genes diferencialmente expressos (GDEs), evitando o “ruído de design in silico” e dando mais robustez ao banco de dados. Os GDEs serão validados através da técnica de PCR quantitativa em tempo real (qPCR). Os resultados esperados compreendem a adequada interpretação e aplicação das ferramentas de bioinformática e técnicas estatísticas para validação da expressão gênica in sílico a partir das análises in vivo, para que seja possível ampliar o conhecimento a respeito do desenvolvimento da formiga cortadeira A. sexdens.