PROSPECÇÃO DE TRANSCRITOS CODIFICADORES DE QUITINASES EM DADOS DE RNA-SEQ DA FORMIGA CORTADEIRA Atta sexdens LINHA DE PESQUISA/PROJETO DA DISSERTAÇÃO
Formigas cortadeiras. Transcriptoma. RNA-Seq. Quitinases.
A formiga cortadeira Atta sexdens apresenta ampla distribuição no Brasil e é considerada um importante inseto-praga de diversas culturas agrícolas devido à sua intensa atividade de forrageio de material vegetal fresco. A intensa desfolhação dessas formigas se deve a necessidade de cultivo do fungo (Leucoagaricus gongylophorus) com o qual vivem em simbiose e do qual se alimentam. Embora muito se saiba sobre a bioecologia destes insetos, ainda são poucos os estudos de validação da função gênica de famílias proteicas que desempenham funções importantes no desenvolvimento das formigas cortadeiras, uma vez que são quase inexistentes os dados moleculares disponíveis para esta espécie. O objetivo deste trabalho consistiu em obter o transcriptoma da formiga cortadeira A. sexdens proveniente do sequenciamento de RNA de cinco amostras biológicas (larva inteira, intestino de larva, formiga forrageadora inteira, cabeça e intestino de formiga forrageadora), visando identificar sequências codificadoras de quitinases, que são enzimas envolvidas na rota de degradação da quitina - um importante polissacarídeo componente de matrizes extracelulares e que desempenha diversas funções nos insetos. Após o sequenciamento realizou-se a montagem de novo dos transcritos utilizando a ferramenta Trinity. A predição de ORFs (do inglês - Open Reading Frames) ocorreu a partir de dados de similaridade e identificação de domínios proteicos, com identificação de 45.253 sequências candidatas a sequências codificadoras. Deste total, 36.639 sequências apresentaram ao menos um domínio depositado no banco de dados PFAM, sendo que foi possível anotar 24.392 sequências contendo ortólogos diretos nos bancos de dados disponíveis no eggNOG. De maneira geral, os transcritos presentes em maior quantidade no transcriptoma de A. sexdens se enquadraram na categoria de mecanismos de transdução de sinais. A partir das análises filogenéticas se identificou potenciais sequências codificadras de quitinases no transcriptoma da formiga cortadeira Atta sexdens. Este trabalho irá contribuir para estudos posteriores que visem elucidar o papel das quitinases no desenvolvimento da formiga cortadeira Atta sexdens.