Agrupamento heterótico de linhagens de milho com dados de genotipagem de SNPs
Diversidade genética. Polimorfismos de nucleotídeo único. Zea mays.
Os avanços das tecnologias de genotipagem têm transformado a forma com a qual os programas de melhoramento gerenciam seus recursos genéticos. A identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) pode beneficiar o entendimento da diversidade genética entre linhagens de milho (Zea mays) e sua subsequente classificação em grupos heteróticos, contribuindo na orientação de cruzamentos para obtenção de híbridos com elevado desempenho. Neste contexto, o objetivo deste trabalho consistiu em agrupar linhagens de milho em grupos, tendo como base os dados oriundos de genotipagem por SNPs. Assim, neste estudo, a diversidade genética de 293 genótipos foi investigada com 5252 SNPs com alelo menos frequente (MAF) >5%. A partir dos resultados, verificou-se que a distribuição média dos SNPs foi de 525 por cromossomo. O conteúdo de informação polimórfica (PIC) apresentou média de 0,297. Com base na matriz de distâncias genéticas, os indivíduos foram agrupados conforme o método hierárquico das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA) e a análise dos componentes principais (PCA), revelando grupos similares, com alto índice de correlação cofenética (0.953 and 0.863, respectivamente). Os resultados demonstraram consistência quando comparados com grupos heteróticos previamente estabelecidos com informações de genealogia e topcrosses. Além disso, subgrupos foram revelados dentro de cada grupo, permitindo uma exploração mais aprofundada da variabilidade genética dentre os materiais.