A utilização de recursos computacionais para cálculos termodinâmicos foi uma revolução nas ciências químicas e apresenta aplicações indispensáveis em sistemas biológicos macromoleculares, como repectores proteicos/enzimáticos e ligantes pequenos. O emprego de cálculos rápidos, baseados em solvente implícito e aproximações de ensembles estatisticos por dinâmica molecular clássica vem ganhando destaque por seus resultados numericamente viáveis e custo computacional drasticamente reduzido em comparação a métodos padrões, como integração termodinâmica e cálculos perturbativos. A aplicação central proposta neste trabalho é dada em protocolos de triagem virtual, em que são necessários cálculos computacionais rápidos e eficientes, para que sejam testadas propostas de diversos ligantes farmacologicamente viáveis em seus respectivos alvos biológicos. A metodologia empregada envolve busca por ligantes estrutural e/ou farmacoforicamente similares a compostos de referência em bancos de moléculas de acesso público, cálculos de ancoramento molecular estatísticamente validados, com caráter discriminatório de atividade biológica, construção de modelos de QSAR baseado em machine learning, predições de propriedades biológicas e físico-químicas de absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicologia (ADMET), simulações de dinâmica molecular clássica e cálculos de energia livre por QM/MM-PBSA e pasiagens de energia livre. Neste trabalhos foram propostos dois manuscritos científicos utilizando essas metodologias, com aplicação à descoberta de agonistas de mGluR7/8 e 5-HT_1A, proteínas altamente correlacionadas com a patogênese do transtorno do espectro autista em humanos, uma condição neuropsiquiátrica que afeta 1 a cada 100 crianças no mundo, com sintomas heterogêneos que se manifestam geralmente em comportamentos sociais restritos, gestos repetitivos, dificuldades de fala e cognição, com comorbidades graves, como depressão, ansiedade e ideação suicida. A aplicação de métodos computacionais rápidos e eficazes são de extrema importância, dado o caráter urgente da problemática e ao fato da inexistência de tratamentos quimioterápicos seguros. Como resultados desses estudos, identificamos 3 agonistas duais de mGluR7/8 com atividade computacional estabelecida e três agonistas seletivos de 5-HT_1A, sendo dois deles já em estágios avançados de testes clínicos.