Banca de DEFESA: THIAGO BERGAMO CARDOSO

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: THIAGO BERGAMO CARDOSO
DATA: 03/09/2020
HORA: 09:00
LOCAL: Online Plataforma Google Meet
TÍTULO:

Drought in Eucalyptus: Identification of gene modules associates with physiological traits, Genome-wide analysis of the long non-coding RNA and AREB/ABF transcription factor family

PALAVRAS-CHAVES:

Rede de co-expressão, WGCNA, lncRNA, defict hídrico, transcriptomica.

PÁGINAS: 120
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Agronomia
RESUMO:

A seca está entre os estresses mais danosos para a agricultura e com o avanço do aquecimento global a tendência é de agravamento. A seca afeta tanto plantas anuais quanto plantas perenes. Espécies de crescimento rápido, como é o caso do eucalipto, tendem a sofrer mais com a falta de água. Eucalyptus é a espécie lenhosa mais plantada no mundo e a maioria destas plantações está localizada nas regiões que serão mais afetadas pelo aumento da temperatura. Devido a urgência desse problema, diversos estudos já foram feitos relacionando o eucalipto a seca, que possibilitou a identificação de espécies contrastantes e algumas rotas metabólicas que auxiliam na tolerância a seca. Uma vez que a tolerância a seca é uma característica multigênica, acredita-se que os reguladores da transcrição, como os fatores de transcrição (FT) e RNA não-codantes, sejam a melhor alternativa para transformar clones sensíveis em tolerantes. Deste modo, este trabalho se propôs a identificar módulos gênicos associados com características fisiológicas relacionadas a esse estresse em clones de eucalipto, tolerante (VM01) e susceptível (VM05), submetidos a diferentes intensidades de seca. Foram identificados 2504 genes, diferencialmente expressos, agrupados em 10 módulos e associados com 18 características fisiológicas quantitativas. Os módulos com os maiores números de associações com características fisiológicas, foram agrupados em padrões de expressão, evidenciando dois padrões contrastantes de aumento da expressão e diminuição com o avanço da seca, indicando possíveis genes responsáveis pelas características contrastantes dos clones. Uma das características fisiológicas que diferenciou o clone tolerante do sensível foi o ácido abscísico (ABA), portanto, este trabalho caracterizou a família gênica ABA-responsive element (ABRE/AREB) binding factors (ABFs), uma das principais famílias de FT responsáveis por regular genes responsiveis ao ABA. Foram identificados 15 membros dessa familia no genoma de Eucalyptus grandis, sendo esses mais expressos em raiz do que em folha. Os genes, diferencialmente expressos na seca, da família AREB/ABF apresentaram redes de co-expressão independentes em raiz e altamente compartilhada em folha, sugerindo um papel regulatório mais diverso em folha. Além dos FT, os RNA longos não-codantes (lncRNA) também apresentam um papel regulatório importante em resposta a estresses. Deste modo, foram caracterizados com alta confiabilidade 1468 lncRNA em Eucalipto. Os lncRNA demonstraram ser tanto tecido específico quanto espécie específico. Em Eucalyptus globulus, oito lncRNA foram diferencialmente expressos em resposta a seca e indicaram participar da regulação de diversos genes conhecidamente relacionados a respostas a seca. Essa tese atingiu o objetivo de realizar análises de prospecção de genes e rotas metabólicas associados com a resposta a seca em eucalipto. Portanto, esse trabalho contribuiu com diversas novas informações a respeito da seca em eucalipto, principalmente, relacionado ao seu processo regulatório. Os artigos gerados poderão servir de fonte para estudos mais aprofundados, focando nos genes sugeridos por esse trabalho, auxiliando no entendimento da regulação gênica do eucalipto em resposta a seca.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - LUCIANO VILELA PAIVA (Membro)
Interno - ALAN CARVALHO ANDRADE - WAGENINGEN (Membro)
Externo ao Programa - ELISA MONTEZE BICALHO - DBI/ICN (Suplente)
Externo ao Programa - EVANDRO NOVAES - DBI/ICN (Membro)
Externo à Instituição - BRENO RÉGIS SANTOS - UNIFAL (Suplente)
Externo à Instituição - ANDERSON TADEU SILVA - WAGENINGEN (Membro)
Externo à Instituição - PAULO EDUARDO RIBEIRO MARCHIORI - UFLA (Membro)