Banca de DEFESA: MIRELLY CAROLINE ALVES

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: MIRELLY CAROLINE ALVES
DATA: 31/08/2020
HORA: 08:00
LOCAL: Online Plataforma Google Meet
TÍTULO:

Identificação e caracterização de duas estipers recombinantes de Potato virus Y

PALAVRAS-CHAVES:

Solanum tuberosum, batata, Potyvirus, estirpes recombinantes, PVY.

PÁGINAS: 110
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Agronomia
RESUMO:

O Potato vírus Y (PVY) possui um complexo de estirpes, originalmente separadas pela reação sintomatológica de plantas indicadoras em três principais grupos:  PVY^O, PVY^N e PVY^C. Recentemente diversos isolados foram identificados resultando principalmente da recombinação entre esses três grupos estirpes, entre outras desconhecidas. O surgimento de novas estirpes tem se tornado uma constante, de modo que a sua identificação é importante não apenas para embasar as pesquisas básicas de melhoramento genético mas também para tomada de decisão nas medidas de controle a serem praticadas no campo. Nesse trabalho duas estirpes denominadas YN-UFLA1, proveniente do Sul de Minas Gerais e LAV-CL, proveniente de um clone do programa de melhoramento genético da UFLA, que apresentaram um comportamento atípico, tiveram o seu genoma completamente sequenciado e caracterizado. Os isolados virais foram multiplicados em plantas de fumo cv. Turkish, e submetidos aos testes sorológicos TAS-ELISA. O estudo dos sintomas foi realizado em plantas de fumo cv. Turkish e cutivares de batata indicadoras. A extração dos RNAs foi realizada a partir de plantas sintomáticas de fumo, para utilização nos testes de RT-PCR multiplex e sequenciamento dos genomas. Os testes de RT-PCR foram realizados para a discriminação entre estirpes, e para o sequenciamento do genoma.  Após o sequenciamento a análise do genoma foi realizada em comparação com outras sequencias do GenBank pelo programa BlastN disponível no site do NCBI. Os alinhamentos múltiplos das sequências de nucleotídeos e aminoácidos e a construção das árvores filogenéticas foram realizados pelos programas Clustaw2 e MEGA 7.0, e as análises de recombinação pelo programa RDP3.44. O isolado LAV-CL foi identificado como um exemplo raro de recombinante, denominado PVY^N-Wi-minus, tipo Wilga b, por apresentar perfil sorológico da estirpe O (PVY^O) e uma organização genômica recombinante característica de N-Wi/N:O, mas não induzir necrose internerval em fumo, que é um sintoma característico de isolados Wilga. Análises de recombinação indicaram este recombinante possui como maior parental o isolado SCRI-O  (AJ585196 - estirpe PVY^O da Inglaterra) e como parental menor o isolado RRA-1 (AY884984 -  Estirpe PVY^N-NA dos Estados Unidos). Quando o LAV- CL foi comparado com dois outros isolados, com os quais apresentou maior identidade, o brasileiro (JQ924281 SGS-AG) e o alemão (AJ890350 Wilga 5), notou-se que esses apresentaram o mesmo padrão de recombinação. Entretanto, houve uma diferença nas junções de recombinação, com o LAV-CL contendo um fragmento faltando mais de 330 pb em relação aos outros dois já conhecidos. O isolado YN-UFLA#1 reagiu apenas com um dos antissoros monoclonais que identificam a estirpe PVY^O, entretanto induziu sintomas necróticos em plantas de fumo e permitiu a amplificação de apenas uma banda de 328bp, no RT-PCR multiplex, o que é característico de estirpes necróticas. A análise de recombinação mostrou que esse isolado é um recombinante novo, ainda não descrito na literatura, que contem quatro fragmentos da estirpe comum, sendo um na extremidade 5’, um na extremidade 3’ e dois intercalados em duas outras posições do genoma. Ambos os isolados estudados estão sendo descritos pela primeira vez no Brasil.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - ANTONIA DOS REIS FIGUEIRA (Membro)
Externo ao Programa - RICARDO MAGELA DE SOUZA - DFP/ECA (Membro)
Externo à Instituição - CAROLINA DA SILVA SIQUEIRA - UFLA (Membro)
Externo à Instituição - SARA MARIA CHALFOUN DE SOUZA - EPAMIG (Suplente)
Externo à Instituição - THAIS OLIVEIRA RAMALHO - UFU (Membro)
Externo à Instituição - DEILA MAGNA DOS SANTOS - UFLA (Suplente)
Externo à Instituição - JOSE DA CRUZ MACHADO - UFLA (Membro)