Banca de DEFESA: RICARDO DIAS CANESCHI

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: RICARDO DIAS CANESCHI
DATA: 29/04/2022
HORA: 09:00
LOCAL: remoto
TÍTULO:

Análise comparativa dos perfis de expressão gênica obtidos por RNA-seq, produzidos a partir de tecidos foliares de plantas de C. arabica submetidas a diferentes estresses abióticos, utilizando-se mapeamento com diferentes genomas de referência (C. arabica, C. canephora e C. eugeniodes).   

PALAVRAS-CHAVES:

   Bioinformática, RNA-seq, mapeamento de genes, Coffea spp.    

PÁGINAS: 90
GRANDE ÁREA: Ciências Agrárias
ÁREA: Agronomia
RESUMO:

   A análise da expressão gênica tem sido amplamente utilizada como um método para estudar a complexa sinalização e as vias metabólicas subjacentes aos processos celulares e de desenvolvimento em organismos biológicos, incluindo plantas. Um número crescente de estudos de níveis de expressão de vários genes em plantas vem sendo realizado para se entender os mecanismos celulares e moleculares envolvidos no desenvolvimento e crescimento de plantas, bem como em respostas a estresses bióticos (infecção por patógenos) e abióticos (ambientais). Altas e baixas temperaturas, seca, alta salinidade, exposição luminosa inadequada são fatores abióticos que afetam o crescimento da planta e causam perdas nas lavouras. Dessa maneira, entender como as plantas percebem esses sinais ambientais e como esses são traduzidos pela maquinaria genética das mesmas com o propósito de minimizar os danos e se adaptarem é de suma importância.  Muitos estudos investigam os efeitos de estresses singulares e combinados e possibilitaram a elucidação da interação molecular complexa que rege respostas ao estresse vegetal. As plantas ativam tanto respostas específicas e não específicas aos estresses causados por fatores relacionados a eventos climáticos adversos, permitindo uma maior eficiência na resposta e conservando recursos para crescimento. A especificidade do sinal é alcançada por meio da interação entre os hormônios de diferentes rotas metabólicas, como o ABA (ácido absisíco), AS (ácido salicílico) e o AJ (ácido jasmônico). Fatores de transcrição, de choque de calor, espécies reativas de oxigênio e pequenos RNAs também estão envolvidos na coordenação de tais respostas. Frisando, os fatores de transcrição são um dos principais responsáveis pela especificidade das respostas aos estresses. A manipulação desses provém uma das maiores oportunidades para conferir tolerância por meio da engenharia genética, uma vez que esses proporcionam uma série de eventos em downstream (XU et al., 2011). Esses fatores interagem com elementos das regiões promotoras dos genes relacionados aos estresses, promovendo uma alta da expressão de vários genes, permitindo então que haja a tolerância ao estresse. (AGARWAL; JHAa, 2010). Uma família de genes conhecidos por fatores ligantes de C-repetitivos (CBFs) ou fatores de elementos ligantes responsivos a desidratação (DREBs) são componentes chaves que implicam na adaptação à seca, salinidade e frio e regulam genes responsivos ao estresse os quais modulam adaptações fisiológicas aos estresses abióticos vegetais. A relação desses fatores compõe uma importante maneira de regulação gênica e rotas metabólicas dependentes e não dependentes ao ácido abscisíco. A alta expressão dos genes DREB, ocasionam a regulação positiva de genes regulados pelo frio (CORE) e genes responsivos ao estresse osmótico, resultando em melhora da tolerância a estresses abióticos (CHEN et al., 2009). Dessa maneira, o intuito desse trabalho foi o de se avaliar o uso de diferentes genomas de referência (C.arabica, C.canephora e C. eugenioides) no mapeamento de reads obtidos por  RNA-seq e observar os efeitos na comparação do transcriptoma de cafeeiros quando submetidas a diferentes estresses abióticos.    

MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - PIERRE ROGER RENÉ MARRACCINI - UPSUD (Membro)
Interno - LUCIANO VILELA PAIVA (Membro)
Externo à Instituição - LUANA FERREIRA TORRES - UFLA (Suplente)
Externo à Instituição - FERNANDA DE ARAÚJO CARNEIRO - UFLA (Suplente)
Presidente - ALAN CARVALHO ANDRADE - WAGENINGEN (Membro)