Le Programme de troisième cycle en ressources hydriques (PPGRH) a été créé par des professeurs du Groupe de recherche sur l'eau et le génie des sols de l'UFLA, et a commencé ses activités en 2010. Il est le résultat du démembrement de la zone de concentration en Ingénierie de l'eau et des sols du Programme d'études du troisième cycle en Ingénierie Agricole, créé dans les années 1980. Son thème central est l'évaluation, l'utilisation et la gestion des ressources en eau dans les systèmes agricoles, qui sont structurés en deux axes de recherche : l'irrigation, l'Hydrologie . Son objectif est la formation de professionnels d'excellence aux niveaux de maîtrise et de doctorat, que ce soit pour le travail en tant que chercheurs, enseignants, expansionnistes ou gestionnaires. Aujourd'hui, le programme a le concept 5 de l'évaluation Capes (2017/2020), et compte sur des subventions financières des organismes de financement nationaux et internationaux, processus de sélection semestriel et partenariats avec des institutions locales et à l'étranger. La ligne de recherche sur l'irrigation vise à la qualification de l'étudiant dans les projets d'irrigation et de gestion, impliquant la quantification et le suivi de la consommation d'eau par les cultures, la capture et le transport de l'eau de surface et souterraine, les systèmes hydrauliques d´irrigation, évaluation des systèmes et des équipements, et les études sur le mouvement de l'eau et les contaminants dans le sol. La ligne de recherche hydrologique dans les Systèmes Agricoles vise à la qualification de l'étudiant pour le développement d'études sur les processus hydrologiques dans les bassins versants, en abordant la surveillance, les analyses qualitatives et quantitatives, la modélisation de la gestion des ressources en eau, l´évaluation des scénarios climatiques et de l'utilisation des sols et de l'hydrologie du sol.