O Programa de Pós-Graduação em Agroquímica(PPGAQ) iniciou suas atividades em março de 1998 com o curso de Mestrado e em 2006 com o curso de Doutorado. Desde 2013 o PPGAQ está conceituado com nota 5 na CAPES. O PPGAQ possui como objetivos: qualificar recursos humanos de alto nível para atuação em pesquisa, extensão, gestão e docência nas áreas de ciências agrárias e química; contribuir para o desenvolvimento de produtos e processos tecnológicos inovadores e ambientalmente compatíveis com o mercado e fundamentar condutas científicas e pedagógicas em padrões éticos e socialmente responsáveis. Ao longo dos anos, vários egressos do Programa ocupam posições na docência em várias Instituições de Ensino Superior (IES) e ensino fundamental, muitos são técnicos de nível médio e superior de IES e muitos ocupam posições em empresas privadas. O Programa possui três linhas de pesquisa bem consolidadas: (i) Bioquímica, Tecnologia de Cachaça e Produtos Naturais e Sintéticos: atuam na avaliação, purificação e identificação de diferentes atividades biológicas dos princípios ativos de plantas (antioxidante, inseticida, parasitária, fungicida, bactericida, antitumoral, controle de obesidade e diabetes e controle de doenças neurodegenerativas) e da avaliação da qualidade de bebidas alcoólicas; (ii) Química Ambiental aplicado a Agricultura: atuam na aplicabilidade da química na agricultura ambiental como na utilização/transformação de resíduos em materiais de valor tecnológico, preparação de catalisadores e adsorventes para aplicações ambientais, produção de biocombustíveis e desenvolvimento de sensores eletroquímicos para determinação de contaminantes orgânicos e inorgânicos voltado para agricultura; (iii) Química Computacional aplicada na Agricultura: atuam na aplicação da química moderna aliada à modelagem computacional, como no desenvolvimento de compostos de interesse terapêutico e agroquímico (QSAR), modelagem molecular de macromoléculas, análise conformacional e catálise computacional. A periodicidade do processo seletivo ocorre anualmente, sempre no primeiro semestre do ano, porém, dependendo da demanda, o PPGAQ disponibiliza vagas no segundo semestre. O Programa possui apoio financeiro do PROAP/CAPES, além dos órgãos de fomento como FAPEMIG, CNPq e FINEP.