Arquitetura cis-regulatória do kinoma de Phaseolus vulgaris: uma abordagem integrativa com dados de expressão gênica
Promotores gênicos, regulação transcricional, kinases, feijoeiro.
As proteínas kinase (PKs) são centrais na regulação de processos fisiológicos e respostas adaptativas em plantas, sendo sua expressão amplamente modulada por elementos cis-regulatórios (CREs) presentes em regiões promotoras. Apesar da caracterização genômica do kinoma de Phaseolus vulgaris, os mecanismos cis que o regulam permanecem pouco explorados. Nesse contexto, este trabalho teve como objetivo caracterizar o perfil cis-regulatório do kinoma do feijoeiro por meio da identificação, classificação e análise de distribuição de CREs, bem como da investigação de seu enriquecimento funcional em diferentes contextos biológicos. Foram mapeados CRES em regiões promotoras putativas (PPRs) (2Kbp a montante do sítio de início de transcrição) de 1.199 genes kinase. Para avaliar variações na densidade de CREs entre famílias, aplicou-se um modelo linear generalizado (GLM) com distribuição de Poisson. A análise estatística revelou diferenças significativas, indicando estratégias regulatórias distintas. A integração com dados transcriptômicos (RNA-seq) sob condições de desenvolvimento, estresse hídrico e infecção por antracnose permitiu identificar cis-elementos regulatórios enriquecidos (e-CREs) associados a genes diferencialmente expressos. Os resultados apontam para uma arquitetura promotora multifuncional e contextualizada no kinoma de P. vulgaris, com CREs associados a vias hormonais, ambientais e de desenvolvimento. Este trabalho oferece suporte para aplicações em engenharia de promotores e no melhoramento genético de leguminosas visando maior resiliência a condições adversas.