El Programa de Post Graduación en Agroquímica (PPGAQ) inició sus actividades en marzo de 1998 con el curso de Maestría y en 2006 con el curso de Doctorado. Desde 2013 el PPGAQ está conceptuado con nota 5 en la CAPES. El PPGAQ posee como objetivos: calificar recursos humanos de alto nivel para actuación en investigación, extensión, gestión y docencia en las áreas de ciencias agrarias y química; contribuir para el desarrollo de productos y procesos tecnológicos innovadores y ambientalmente compatibles con el mercado y fundamentar conductas científicas y pedagógicas en estándares éticos y socialmente responsables. A lo largo de los años, varios egresados del Programa ocupan posiciones en la docencia en varias Instituciones de Enseñanza Superior (IES) y enseñanza fundamental, muchos son técnicos de nivel medio y superior de IES y muchos ocupan posiciones en empresas privadas. El Programa posee tres líneas de investigación bien consolidadas: (i) Bioquímica, Tecnología de Cachaza y Productos Naturales e Sintéticos: actúan en la evaluación, purificación e identificación de diferentes actividades biológicas de los principios activos de plantas (antioxidante, insecticida, parasitaria, fungicida, bactericida, antitumoral, control de obesidad y diabetes y control de enfermedades neurodegenerativas) y de la evaluación de la calidad de bebidas alcohólicas; (ii) Química Ambiental aplicada a la Agricultura: actúan en la aplicabilidad de la química en la agricultura ambiental como en la utilización/transformación de residuos en materiales de valor tecnológico, preparación de catalizadores y absorbentes para aplicaciones ambientales, producción de biocombustibles y desarrollo de sensores electroquímicos para determinación de contaminantes orgánicos e inorgánicos dirigido a la agricultura; (iii) Química Computacional aplicada en la Agricultura: actúan en la aplicación de la química moderna aliada al modelo computacional, como en el desarrollo de compuestos de interés terapéutico y agroquímico (QSAR), modelo molecular de macromoléculas, análisis conformacional y catálisis computacional. La periodicidad del proceso selectivo ocurre anualmente, siempre en el primer semestre del año, pero, dependiendo de la demanda, el PPGAQ pone a disposición vacantes en el segundo semestre. El Programa posee apoyo financiero del PROAP/CAPES, además de los organismos de fomento como FAPEMIG, CNPq y FINEP.