Le Programme des troisièmes cycles en Microbiologie Agricole accorde des subventions intellectuelles aux diplômés pour qu'ils travaillent dans des institutions publiques, privées d'enseignement et/ou de recherche, dans le développement de processus, de produits, de contrôle de la qualité et de développement technologique basé sur la Microbiologie Appliquée à l'Agro-industrie ; microbiologie environnementale et industrielle ; microbiologie des sols ; microbiologie alimentaire ; physiologie des Micro-organismes ; génétique des micro-organismes en particulier dans les techniques moléculaires et bio-informatiques. Le PPGMA ouvre un processus de sélection tous les six mois. Les étudiants participants peuvent recevoir des bourses d'études de grands organismes de financement comme CAPES, CNPq et FAPEMIG. À titre de note 6 dans l'évaluation CAPES, le PPGMA apporte une contribution financière annuelle de CAPES par l'intermédiaire de PROEX. Les projets de recherche sont maintenus par des propositions de ressources approuvées dans les décrets d'entreprises publiques ou privées. Le PPGMA a trois axes de recherche : 1 - Écologie, génétique et physiologie des micro-organismes, Physiologie et génétique des micro-organismes issus d'environnements agricoles et naturels ; caractérisation et surveillance des populations et des communautés microbiennes ; étude de leurs relations fonctionnelles dans divers environnements, tels que le sol, l'eau, les plantes, les aliments, les animaux et les déchets agro-industriels, y compris l'application de techniques biochimiques, protéomiques et moléculaires, y compris la métagénomique. 2 - Biotechnologie de micro-organismes appliqués à l'agriculture et à l'environnement, Processus et développement de technologies microbiennes pour le rétablissement des écosystèmes, l'amélioration des processus biologiques naturels avec une production animale et végétale accrue et consolidation de la durabilité de l'agro-industrie. Micro-organismes prometteurs de croissance et avec un potentiel de contrôle biologique. Connaissance et développement de processus fermentatifs spontanés utilisés dans la préparation de divers aliments et boissons, pour l'alimentation animale et le développement de méthodes et de diagnostiques et produits pour l'amélioration de la santé animale, visant à l'amélioration des produits et l'augmentation de l'agro-industrie durable. 3 - Qualité et sécurité microbiologique des aliments. Évaluation des points de contrôle critiques à toutes les étapes de la production et de la transformation des aliments et de la caractérisation du microbiote terroir. Analyse de la dynamique des populations microbiennes présentes dans l'évaluation des aliments et des risques pour l'environnement, la santé humaine et la santé publique.