ESTIMAÇÃO DE PARÂMETROS GENÉTICOS E IDENTIFICAÇÃO DE REGIÕES GENÔMICAS ASSOCIADAS A CARACTERÍSTICAS DE IMPORTÂNCIA ECONÔMICA DA RAÇA NELORE
eficiência alimentar; reprodução; seleção; single-step, ssGWAS.
A seleção para características de eficiência alimentar e reprodução tem ganhado destaque nos programas de melhoramento genético de bovinos de corte devido ao impacto sobre a produtividade e a rentabilidade na pecuária. Este trabalho tem como objetivo estimar os componentes de variância e os parâmetros genéticos de características de eficiência alimentar e reprodução, além de identificar regiões genômicas, marcadores Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) e possíveis genes candidatos associados ao consumo alimentar residual (CAR), idade ao primeiro parto (IPP) e probabilidade de parto precoce (3P). Serão utilizados dados fornecidos pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), contendo informações fenotípicas de 998.886 animais puro de origem (PO) da raça Nelore, nascidos entre 2010 e 2024. Além de um banco com 25.490 animais genotipados com painel de baixa densidade Clarifide Nelore 3.0. As características avaliadas serão CAR, ingestão de matéria seca (IMS), IPP, 3P, stayability (STAY), período de gestação (PG), produtividade acumulada (PAC), idade à puberdade de machos (IPM), perímetro escrotal aos 365 dias (PE365) e aos 450 dias (PE450). Para o controle de qualidade (CQ) das características contínuas, serão considerados apenas grupos contemporâneos (GC) com 10 ou mais animais, excluindo aqueles fora desse padrão, bem como animais com valores ±3,5 desvios-padrão da média do grupo. Para as características categóricas, serão considerados apenas GC com 15 ou mais animais e no mínimo três categorias diferentes. Os componentes de (co)variância e os parâmetros genéticos serão obtidos via inferência Bayesiana, utilizando o algoritmo de amostragem de Gibbs pelo método single-step em modelos animal uni e bicaracterísticos, além de modelo threshold para 3P e STAY. Para a análise de single-step genome-wide association study (ssGWAS), serão preditos valores genéticos genômicos (GEBVs) pelo método ssGBLUP utilizando o programa BLUPF90+, e os efeitos dos SNPs serão obtidos via backsolving no POSTGSF90. A significância dos marcadores será determinada com base nos p-valores, utilizando correção de Bonferroni e visualização dos resultados por gráficos Manhattan e QQ plot. Assim, este estudo busca compreender se a seleção para maior eficiência alimentar pode comprometer características de precocidade sexual e fertilidade de fêmeas Nelore, além de identificar regiões genômicas associadas a essas características, contribuindo para o aprimoramento dos programas de melhoramento genético na seleção da raça.